李志明正忙于准备穿梭时空，三战前的几年他的权力就越来越大了，当一个组织凌驾于国家之上，掌控着曾经几十个国家的领土和权力的时候，作为这个组织的副手其地位和身份之高便可想而知了，相应的手中的权力也有难以想象的巨大。
李志明算是赶上了末班车，他进入自然科学研究院的时候已经年纪不小了，但他一路飞黄腾达，短短时间内就爬到了行政部部长和副院长的位置。这不能说绝无仅有却也是在组织内十分罕见的，尤其是如今的自然科学研究院早已超脱了一个异能组织这么简单的身份。大多数旁观者只能对李志明的站队能力和判断预见性望尘莫及，实际上李志明屡屡押对宝走对棋，着实让人无法感叹这只是运气所致。
谁也不知道，其实这一切源于李志明收到的信号。那一年他刚刚进入自然科学研究院，正在执行任务的时候他突然晕厥昏倒，然后就昏迷了三天，这三天里他做了一个梦，梦到了未来的自己，也看到了末日的景象。如果所梦到的一切都是真的，他与未来的自己不是两个位面两个平行时间不交融的个体，而是时空回逆的结果。那么未来的自己就把希望寄托在了回逆的自己身上，如果李志明改变了当下，那么未来就会因此改变结局。
李志明清楚他不是在拯救别人，而是在拯救自己，或者说是拯救当下的自己。未来的自己已经生命垂危，而且早已是油尽灯枯，即便自己改变了历史，他依然还是个老头。但他不想让悲剧重演，或者说他想让时空回逆中的自己能够不再遗憾。
无论是未来还是现实，自己的目的就是救活蓝衫，而人死不能复生，除非回到时光逆流中的过去，在时空回逆中拯救蓝衫。李志明在初次尝试未来经验后喜不胜收，因为事实证明一切都是真的，梦果真来自于未来。借助着未来自己对时局的预知以及组织内的内部更替与权力斗争的已知结果，李志明每次都押对宝办对事，虽然他发现因为自己的错位干预，导致很多事情发生了蝴蝶效应般的改变，但历史的修复能力还是会让很多事情发生，其结果大同小异，这便让他更加如鱼得水了。
不过他还是有些担忧，担心最后的自己也会如同修正的历史一般逃不过宿命。不过起码现在李志明更早的当上了部长和副院长，也有了相比未来更大的权力。大权在握后，太岁计划更加顺利的研发了，与曾经历史一样的是三战的到来，不过起因略过异电萃取技术直接指向了太岁计划。
而叛逃者仍然出现了，只是换了一个人，原先的人被李志明秘密处决了。有了来自未来的记忆，李志明带领自然科学研究院的人少走了很多弯路，他也在组织能获得了更高的声望。李志明需要太岁计划，里面有自己渴望的能力，那是穿越时空，让时间回逆的东西，只是这个部件掌握在黑雅手中。
后来通过一系列操作和交换，以及李志明从中的相互瞒骗自然科学研究院得到了这个部件，并在吴用的带领下研制出了可以穿梭时空的机器。而李志明发现正如未来所说的那样，自己是光的使者、空间的缔造者，使用自己的异能可以做到穿梭平行时空后更高一层的时空回逆。这种空间能力被研发部复制了下来，并利用机器取代，虽然效果不是那么好，但主动权不再独掌于在李志明手中了。
自然科学研究院的穿越只是为了了解历史，至于时空回逆只是保留在最后的杀手锏。破坏其他位面平行世界的历史造不成什么影响，但时空回逆就不同了，它会造成很严重的后果，所以这项技术一经掌握就立刻冷藏了。所谓限制不如彻底断绝来的干脆，人的贪心是无法满足的，有了第一次穿越的甜头便会想第二次。
时空回逆听起来神奇，但细细分析起来却极其恐怖，稍有不慎可能导致整个人都不存在了，而蝴蝶效应所致会在一定程度上改变历史，甚至可能导致自然科学研究院的彻底消失，这些都有可能，这令组织忌惮也使当权者恐惧。
想要修正？让事情回到本来的样子？那便需要再一次穿越，而时空回逆的穿越需要平行锚点准确的落在自己这个世界位面的曾经，这种穿越难度极大危险系数也很高，稍有不慎就会连人带时光机迷失在时空的长河当中。况且谁知道这种穿越会不会遗漏什么，再度引发大的蝴蝶效应呢？谁也不敢冒这个险，如今的局势挺好，又何必冒险呢？
这次李志明失算了，他原以为借助组织获得时空回逆的科技，然后就可以凭借自己在组织内的权力救回蓝衫，结果他却发现一切并没有自己想象的那么简单，而所受的阻力也是超乎想象的，手中的权力更没有自己估计的那样高。六老和另一个副院长蒋传芳此刻站到了一起，彻底冷藏了穿越技术，声称不到万不得已不可使用。
李志明开始预谋自己偷偷使用机器甚至制造另一个时空穿越器，毕竟最难的在于时空回逆而不是穿越本身，只要连接他的异能他就能做到，故此仅发明一个时空传送机对组织内盟友吴用来说不是什么难事。至于消耗巨大能量之说，以李志明目前的身份地位，想要瞒天过海是轻而易举的。但屡屡穿越后，蓝衫还是无法复活，他这才发现有人在阻挠着他。
他刚拯救了蓝衫，回来后记忆发生改变，但蓝衫依然死于疾病和灾难。他发现每每他前脚穿越，后脚就有人再度改变历史，而阻止自己的正是自然科学研究院的同僚。后来李志明才知道，这些同僚他们经过分析得出一个结论，如果蓝衫还活着李志明就不会天天抑郁，继而产生异能的改变。如果李志明没有异能突变，或者说晚一些发生异变，很多事情就不会发生，甚至连太岁计划的开发都会受到影响，这就对触犯很多人的利益，此刻过往的重要和优秀反而成了阻碍和他人阻拦的理由。
李志明悲愤交加却又无力抵抗整个组织，而他穿越的权力也被监控，为此还牵连了几个忠心耿耿的手下，若不是有人替李志明抗罪，只怕李志明便会被群起而攻之成为众矢之的。攘外必先安内，一场内部的政治斗争开始了，李志明甚至不惜拉拢黑雅和卐达到自己的目的。
他成功找到了海赫和游魂，并注意未来失败的缘由尽量避免，神不知鬼不觉的把两人归为自己麾下，同时联络翟清，四人与三大组织提出了条件。四人的组合让太岁计划得到了极大的开发，然而三大组织却在各自得到自己想要的技术后，同时做出了撕毁条约的无耻举动。李志明太天真了，这种三大组织的连环担保在连环否认后变得毫无作用。最终翟清被俘，海赫与游魂依然没有逃离肉体毁灭的结局，而李志明则带着死党进行着最后的反抗。
由自然科学研究院分裂开始，第四次世界大战拉开了序幕。历史的修正让这场毁灭世界的大战依旧发生了，只是由于李志明的干预它提前到来了，最终的结局也不是核战引发的，可以说未来的李志明最不希望的世界毁灭，反倒是让过去的自己给推动了进程。
大战中虚实组成的数码怪兽，反制怪兽所用的全境干扰波，傀儡军团的勇往直前和灵魂力量的波动武器，这些在未来没有出现过的高科技武器纷纷登场，大家互相制约相互打击，谁也没办法全面击溃对方。
然而作为底子最薄实力最弱的李志明等人，又是出头跟三方谈判或者说“要挟”的人，是首当其中被三方共同火力“照顾”的对象。所以三方互相制约各有胜败，但李志明一伙却是最先被打的支离破碎的人，不过因为在战时，还得提防其他人，故此对李志明的追缴也是不紧不慢的，这倒是给了他活下去的机会。
李志明自然不甘于此，他找到了追随自己的吴用，告诉了他们关于未来的秘密。吴用将信将疑，最近他和蔡枫以及程商等人的情绪很大，毕竟本来位高权重的他们，如今却成了组织公敌，只能惶惶不可终日宛如下水道的老鼠一般见不得光。这样的高低落差和地位变化是他们所不能接受的，而相互之间感情的不牢靠在大难临头之日发生了变化，他们几个尚且如此，他们各自的属下就更加人心惶惶各有心思了。
李志明对他们坦诚了未来，而他们则怀疑历史变化后的未来后果。于是一场秘密试验开始了，吴用的智慧的确非常人可以比拟，他通过技术手段，刺激李志明异能变化，使之有了飞跃式的提高，于是他们顺利突破了穿越的难题——只能回到过去不能前往未来。
时间锁定在了五年之后，在那里他们看到了一副令人难以想象的场景，世界百分之八十的土地再次被海水淹没，剩下的则是荒漠和城市废墟。人类早在两年前的太岁爆发中死去大部，地球依然毁灭了，无法治愈的病毒，突然成为数码消失的山川河流，愈发恶劣的自然环境，这些不可思议的事情接连上演。
只是由于人类的科技要比原先的未来还要强大，故此有人逃离了地球，在几年前修建的太空基地上生存着。但逃离地球的人只是少数，甚至不足十万分之一的数量，大部分人依然是这场惨剧的受害者。
他们回到了自己的基准时间，每个人都沉默了，好像无论是未来还是改变后的未来，世界的毁灭都无法阻止。每次的改变只能让灾难更加提前的降临，而到那时每个人都是受害者，即便他们能够去外太空避难，但他们的家人亲朋却依然会死在浩劫中，而每个人的梦想也就此终结了。
李志明喊出了大义凛然的口号，他要拯救这个世界。于是，他们的计划开始了，一年后，自然科学研究院捕捉到了一段穿越信号，但追随信号反穿越的追杀中却迷失了方向。自然科学研究院的工作人员惊奇的发现，李志明他们穿越到了一个平行的世界，他们究竟要做什么！三方停战了，他们共同对付起了李志明，因为这种穿越的未知让他们感到不安。